Eiweißabschäumer werden in der Meerwasseraquaristik zur Schadstoffentfernung und zur Entlastung des Filter eingesetzt. Als reine Abschäumer oder in Kombination mit einen Ozongenerator sind Eiweißabschäumer sehr effektive Geräte zur Entfernung von organischen Ausscheidungen, Schadstoffen oder einem Überangebot an Nährstoffen im Wasser. Bei der Abschäumung werden die Schadstoffe an die durch die Pumpe erzeugten Luftblasen im Reaktionsrohr angelagert. Durch die besondere Konstruktion des Reaktionsrohres haben die Luftplasen eine lange Verweilzeit im Wasser, wodurch sich viele Moleküle an die Luftblasen lagern können. Die Luftblasen steigen nach oben und sameln sich als Schaum im Schaumtopf. Es gibt luftbetriebene und motorbetriebene Abschäumer. Modelle für kleinere Aquarien werden direkt im Becken als Innenabschäumer eingesetzt, wohingegen Außenabschäumer im Unterschrank innerhalb oder außerhalb des Filterbeckens installiert werden.